More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1506 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  100 
 
 
249 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  83 
 
 
243 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  83 
 
 
243 aa  351  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  78.86 
 
 
246 aa  345  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  79.6 
 
 
250 aa  337  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  67.87 
 
 
249 aa  315  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  68.77 
 
 
247 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  66.8 
 
 
234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  59.2 
 
 
270 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  59.2 
 
 
270 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  59.2 
 
 
237 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  58.8 
 
 
237 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  58.8 
 
 
237 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  58.8 
 
 
237 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  58.8 
 
 
237 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  58 
 
 
237 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  60.49 
 
 
232 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  58.4 
 
 
237 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  60.89 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  59.43 
 
 
251 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  60.89 
 
 
234 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  62.35 
 
 
233 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  58.85 
 
 
234 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  56.5 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 
234 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 
234 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 
234 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  56.68 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  56.33 
 
 
244 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  60.82 
 
 
231 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  56.07 
 
 
243 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  57.02 
 
 
234 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 
227 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  45.83 
 
 
227 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  52.03 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  48.19 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  58.85 
 
 
233 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
231 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  56.38 
 
 
233 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  43.32 
 
 
228 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  52.82 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  49.26 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  49.26 
 
 
224 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  56.84 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  56.72 
 
 
234 aa  178  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  53.5 
 
 
230 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  49.26 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  56.84 
 
 
231 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  49.75 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  49.75 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  49.26 
 
 
224 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  49.26 
 
 
224 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  49.26 
 
 
224 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  50.25 
 
 
228 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  55.22 
 
 
236 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  48.77 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  47.29 
 
 
224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  48.28 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  52.91 
 
 
230 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  53.44 
 
 
230 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
228 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  40.87 
 
 
273 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  43.53 
 
 
282 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 
232 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  53.48 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  51.01 
 
 
237 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  48.07 
 
 
228 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 
239 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  44.87 
 
 
245 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  44.87 
 
 
245 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1816  integral membrane protein TerC  44.54 
 
 
242 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.34813  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  48.97 
 
 
223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  48.45 
 
 
224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  49.47 
 
 
287 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  45.13 
 
 
233 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  47.94 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  47.94 
 
 
223 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  47.94 
 
 
223 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  47.94 
 
 
223 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  47.94 
 
 
223 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  47.94 
 
 
223 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  48.17 
 
 
223 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  46.45 
 
 
219 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
225 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
238 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  47.64 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
223 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  51.34 
 
 
230 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  42.22 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2121  hypothetical protein  52.63 
 
 
273 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  51.92 
 
 
232 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  40.64 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  43.39 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  43.39 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  40.61 
 
 
258 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  41.84 
 
 
233 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5883  integral membrane protein TerC  64.52 
 
 
111 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  38.65 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  40.59 
 
 
221 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>