54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0521 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0521  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  74.04 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  74.07 
 
 
109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  72.12 
 
 
104 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  72.12 
 
 
104 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  71.7 
 
 
106 aa  166  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  68.93 
 
 
103 aa  160  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  69.9 
 
 
106 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  61.54 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  62.14 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  55.45 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  55.45 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  55.45 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  55.45 
 
 
107 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  55.45 
 
 
107 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  55.45 
 
 
107 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  55.45 
 
 
107 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  55.45 
 
 
107 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  56.38 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  56.38 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  56.38 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  56.38 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  56.38 
 
 
109 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  51.49 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  52.48 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  56.38 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  52.48 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  54.08 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  55.32 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  53 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  53.47 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  54.08 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  54.12 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  54.12 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  45.26 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  42.17 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  35.96 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5222  hypothetical protein  43.43 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  35.48 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  35.96 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4693  hypothetical protein  46.34 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  39.77 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0305  hypothetical protein  43.9 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4925  hypothetical protein  43.9 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5343  hypothetical protein  43.9 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.740309  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3023  hypothetical protein  43.9 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3387  hypothetical protein  42.17 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0103  hypothetical protein  39.33 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.844457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0605  hypothetical protein  35 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0444  hypothetical protein  35 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  28 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>