21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0189 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  251  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  51.46 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  50.53 
 
 
108 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  50.53 
 
 
108 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  49.47 
 
 
108 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  47.37 
 
 
108 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  47.37 
 
 
108 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  41.12 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.95 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  35.44 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  30.61 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3370  hypothetical protein  30.93 
 
 
109 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101654  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  30.77 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  31.03 
 
 
127 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>