17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5918 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  40.35 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  32 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  38.57 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  47.73 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3761  hypothetical protein  33.87 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000832493  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  50 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  32.26 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  32.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  39.53 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  36.36 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  38.1 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  41.86 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>