22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3611 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1071  hypothetical protein  52.69 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2284  hypothetical protein  48.96 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  32.91 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  34.94 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  43.08 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  43.08 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.74 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  28.74 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  27.59 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1151  hypothetical protein  53.76 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  34.67 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  31.71 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  41.07 
 
 		 91 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 91 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1675  hypothetical protein  32.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.532109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>