10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3183 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4835  hypothetical protein  37.44 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2265  hypothetical protein  30.92 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0374  hypothetical protein  34.67 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2586  hypothetical protein  38.04 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3747  hypothetical protein  30.22 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1552  hypothetical protein  33.64 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0744  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0418  hypothetical protein  28.19 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  35.23 
 
 		 575 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>