30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0137 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  61.82 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  75.29 
 
 		 100 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  76.25 
 
 		 95 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  72.84 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  69.88 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  69.88 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  59.18 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  71.6 
 
 		 100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  72.97 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  75.38 
 
 		 69 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  68.12 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  71.64 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  71.64 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  58.02 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  39.17 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  32 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  32.89 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  36.99 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  29.63 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  38.1 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  34.29 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  32.86 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  39.66 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  37.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  37.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  30.11 
 
 		 361 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  35.62 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  34.78 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>