13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2720 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0285    99.9 
 
 		 1349 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0743    99.9 
 
 		 2312 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0971    99.9 
 
 		 2219 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1409    99.8 
 
 		 2567 bp  1976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1440    99.9 
 
 		 1355 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.368011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2468    99.8 
 
 		 2102 bp  1978    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2720    100 
 
 		 2729 bp  5410    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0157    99.9 
 
 		 2801 bp  2002    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2612    96.15 
 
 		 341 bp  87.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  86.49 
 
 		 1749 bp  67.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  81.25 
 
 		 1737 bp  63.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  83.7 
 
 		 1752 bp  63.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  86.79 
 
 		 2055 bp  50.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>