75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00273 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00273  chorismate lyase  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002145  chorismate--pyruvate lyase  91.62 
 
 		 179 aa  340  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.256754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2420  chorismate--pyruvate lyase  65.36 
 
 		 183 aa  243  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2896  chorismate--pyruvate lyase  51.43 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3774  chorismate pyruvate lyase  39.52 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0678  chorismate pyruvate lyase  39.52 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3864  chorismate pyruvate lyase  39.52 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3528  Chorismate lyase  39.16 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4464  chorismate pyruvate lyase  39.63 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0971  chorismate pyruvate lyase  35.58 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00931015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0510  chorismate pyruvate lyase  37.66 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3402  Chorismate lyase  35.88 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.750194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0729  chorismate pyruvate lyase  37.01 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4576  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464602  normal  0.0352552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0243  chorismate pyruvate lyase  34.51 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4575  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4490  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.232618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4627  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4425  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4558  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4501  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3989  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4592  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4279  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5520  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03871  hypothetical protein  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03911  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3954  Chorismate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00071  hypothetical chorismate pyruvate lyase  33.71 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  32.45 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0150  chorismate lyase  34.36 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3594  chorismate lyase  31.79 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3468  chorismate lyase  35 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0125  putative chorismate--pyruvate lyase  27.66 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4826  chorismate lyase  28.49 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0048  chorismate lyase  25.6 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0053  chorismate lyase  32.24 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2439  chorismate lyase  29.41 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3623  putative chorismate--pyruvate lyase  28.65 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0095  chorismate lyase  26.74 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0126  chorismate lyase  28.66 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0131  chorismate pyruvate lyase  28.02 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0126  chorismate lyase  28.42 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3743  chorismate lyase  27.2 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.219217  hitchhiker  0.000343394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0120  chorismate lyase  28.42 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0125  chorismate lyase  27.47 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145702  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  26.22 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4148  chorismate lyase  25.41 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4431  chorismate lyase  27.2 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000175928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4229  chorismate lyase  25.82 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0130  chorismate lyase  25.82 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0125  chorismate lyase  25.82 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0129  Chorismate lyase  25.82 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70720  hypothetical protein  33.77 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6134  hypothetical protein  33.77 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  32.48 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  32.48 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0658  chorismate lyase  29.17 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1335  chorismate--pyruvate lyase, putative  29.03 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  32.08 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5030  chorismate lyase  29.52 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48500  Chorismate lyase  32.28 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0141  putative chorismate--pyruvate lyase  27.67 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5603  chorismate lyase  30.63 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4410  chorismate lyase  31.61 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0608691 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2049  chorismate--pyruvate lyase  27.67 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  27.85 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  30.63 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0710  chorismate lyase  27.74 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00949148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2154  chorismate lyase  24.67 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5475  chorismate-pyruvate lyase, putative  29.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2780  hypothetical protein  29.65 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  24.36 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3024  Chorismate lyase  28.93 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0966  chorismate lyase  27.33 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0938345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>