75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002145 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002145  chorismate--pyruvate lyase  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.256754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00273  chorismate lyase  91.62 
 
 		 179 aa  340  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2420  chorismate--pyruvate lyase  63.69 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2896  chorismate--pyruvate lyase  50.29 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3528  Chorismate lyase  39.16 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3774  chorismate pyruvate lyase  38.69 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0678  chorismate pyruvate lyase  38.69 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3864  chorismate pyruvate lyase  38.69 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4464  chorismate pyruvate lyase  39.02 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0971  chorismate pyruvate lyase  37.93 
 
 		 171 aa  104  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00931015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3402  Chorismate lyase  36.75 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.750194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0510  chorismate pyruvate lyase  38.96 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0729  chorismate pyruvate lyase  38.31 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4576  chorismate pyruvate lyase  35.92 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464602  normal  0.0352552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4575  chorismate pyruvate lyase  35.92 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4490  chorismate pyruvate lyase  35.92 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.232618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4627  chorismate pyruvate lyase  35.92 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4425  chorismate pyruvate lyase  35.92 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0243  chorismate pyruvate lyase  35.21 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4558  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4501  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3989  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4592  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4279  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5520  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03871  hypothetical protein  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03911  chorismate pyruvate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3954  Chorismate lyase  33.8 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  31.55 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0150  chorismate lyase  33.14 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00071  hypothetical chorismate pyruvate lyase  31.46 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3594  chorismate lyase  32.75 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3468  chorismate lyase  35.03 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0125  putative chorismate--pyruvate lyase  29.84 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4826  chorismate lyase  32.8 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3743  chorismate lyase  28.8 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.219217  hitchhiker  0.000343394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2439  chorismate lyase  29.59 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0048  chorismate lyase  26.21 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0126  chorismate lyase  33.75 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0126  chorismate lyase  30.38 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0131  chorismate pyruvate lyase  30.26 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0120  chorismate lyase  30.38 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0125  chorismate lyase  30.57 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145702  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3623  putative chorismate--pyruvate lyase  28.11 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0095  chorismate lyase  30.71 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0053  chorismate lyase  29.75 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  26.99 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0129  Chorismate lyase  28.49 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4229  chorismate lyase  28.49 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0130  chorismate lyase  28.49 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0125  chorismate lyase  28.49 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1335  chorismate--pyruvate lyase, putative  30.92 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4431  chorismate lyase  26.4 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000175928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4148  chorismate lyase  31.3 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70720  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6134  hypothetical protein  35.81 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5030  chorismate lyase  31.37 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4410  chorismate lyase  33.77 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0608691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  31.21 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0141  putative chorismate--pyruvate lyase  26.97 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2049  chorismate--pyruvate lyase  26.97 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0658  chorismate lyase  27.56 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  31.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48500  Chorismate lyase  31.85 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0710  chorismate lyase  28.1 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00949148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5603  chorismate lyase  29.68 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  27.85 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  30.57 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2154  chorismate lyase  23.33 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5475  chorismate-pyruvate lyase, putative  30.82 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  29.94 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3024  Chorismate lyase  28.48 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2780  hypothetical protein  28.65 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  25.81 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3058  chorismate lyase  27.39 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0224011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>