12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000898 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000898  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06896  hypothetical protein  83.14 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003676  hypothetical protein  49.2 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003711  hypothetical protein  36.19 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0805647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02091  hypothetical protein  34.4 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  26.03 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  23.74 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>