46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000678 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  100 
 
 
334 aa  683    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  88.02 
 
 
340 aa  614  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  56.76 
 
 
335 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  56.76 
 
 
335 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  51.07 
 
 
333 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  53.01 
 
 
337 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  51.8 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  52.58 
 
 
332 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  52.91 
 
 
340 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  56.5 
 
 
335 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  49.54 
 
 
359 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  52.27 
 
 
330 aa  341  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  53.19 
 
 
336 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  51.98 
 
 
329 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  53.19 
 
 
336 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  52.28 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  47.89 
 
 
333 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  51.81 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  47.89 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  47.59 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  48.8 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  47.42 
 
 
331 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  46.69 
 
 
333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  46.44 
 
 
346 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  46.75 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  38.72 
 
 
337 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  39.29 
 
 
349 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  39.34 
 
 
363 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  36.63 
 
 
348 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  36.49 
 
 
348 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  35.59 
 
 
340 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  30.38 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.19 
 
 
348 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  35.86 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  35.92 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  36.26 
 
 
341 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  36.23 
 
 
343 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  34.52 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  28.94 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  34.41 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  34.41 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  27.53 
 
 
353 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  30.34 
 
 
392 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  29.15 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  28.62 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0502  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  22.81 
 
 
306 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>