18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0561 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0561  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  255  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000718  hypothetical protein  58.68 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06603  lactoylglutathione lyase  59.5 
 
 		 121 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.72 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3727  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.06 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04357  glyoxalase family protein  47.5 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1608  hypothetical protein  53.75 
 
 		 80 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000377163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2084  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1671  hypothetical protein  36.67 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  36.84 
 
 		 267 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  35.96 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2123  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1450  hypothetical protein  30.36 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01187  Lactoylglutathione lyase 2396  30.51 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1609  hypothetical protein  47.22 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000295369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3503  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03509  bleomycin resistance protein  27.27 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>