28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1411 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1411  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
207 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1565  peptidase A24A domain-containing protein  30.08 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3416  peptidase A24A domain-containing protein  30.94 
 
 
254 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.53 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  29.5 
 
 
255 aa  52  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  28.78 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  31.91 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.35 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0458  prepilin peptidase  28.14 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  37.76 
 
 
269 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  37.76 
 
 
269 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  37.76 
 
 
269 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  36.73 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  29.53 
 
 
278 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.29 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  30.43 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  28.97 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  28.66 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  31.4 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  35.71 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  35.71 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1839  peptidase A24A domain protein  25.5 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.639181  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  39.29 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  27.2 
 
 
247 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  31.75 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  27.61 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  27.2 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  40.35 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>