23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1796 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  97.22 
 
 
252 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  39.74 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
390 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  36.78 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  35 
 
 
222 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  33.19 
 
 
245 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  37.75 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
441 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  32.78 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  32.16 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
260 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  31.86 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  32.58 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  32.47 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  35.46 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
456 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  36.13 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3994  hypothetical protein  45.57 
 
 
86 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>