29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1372 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  97.1 
 
 		 75 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  59.7 
 
 		 74 aa  89.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  47.3 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  41.89 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  46.27 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  46.77 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  40.85 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.39 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.05 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  27.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0843  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0194425  normal  0.0837964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1172  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.51 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  34.33 
 
 		 666 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30 
 
 		 163 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  27.78 
 
 		 163 aa  40.8  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.21 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.21 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1317  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.39 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.14 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1369  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  26.39 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.58 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.58 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  37.14 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25 
 
 		 160 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>