47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1538 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  695    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  41.46 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  40.82 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  42.64 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  35.37 
 
 		 337 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  33.67 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  38.8 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  38.8 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  34.17 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  32.53 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  34.89 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  32.73 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  33.57 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  33.57 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  32.36 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  32.95 
 
 		 348 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  32.16 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  34.31 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  33.21 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  32.26 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  31.32 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  30.66 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  29.73 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  31.63 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  31.74 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  31.23 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  31.63 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  32.9 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  31.02 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  30.51 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  31.16 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  30.82 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  28.11 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  29.86 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  28.11 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  32.03 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  32.08 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  32.08 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  33.07 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  30.6 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  30.42 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  31.74 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  27.53 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  30.58 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2898  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase/UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase  30.65 
 
 		 1005 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0124721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1406  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  25.25 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>