12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1436 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  41.41 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  40.82 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  35.64 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  36.89 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  56.1 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 131 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>