11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1033 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.690507  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2026  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.76 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000340958 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0473  hypothetical protein  21.67 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0928  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.03 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00958185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1044  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.38 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0014  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.09 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  25.21 
 
 		 404 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0474  hypothetical protein  23.02 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  24.08 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  41.94 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  21.8 
 
 		 365 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>