16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0472 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0472  ribosomal protein L39e  100 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0442  50S ribosomal protein L39e  58 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0986  50S ribosomal protein L39e  60 
 
 		 51 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1678  50S ribosomal protein L39e  60 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1792  50S ribosomal protein L39e  56 
 
 		 51 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0484601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  49.02 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  52.94 
 
 		 51 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1164  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 51 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1516  50S ribosomal protein L39e  48 
 
 		 51 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.151323  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1000  ribosomal protein L39e  52 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.527424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1159  50S ribosomal protein L39e  48 
 
 		 51 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0791  50S ribosomal protein L39e  48 
 
 		 51 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.669936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0202  ribosomal protein L39e  54.9 
 
 		 52 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.768835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1569  50S ribosomal protein L39e  54.76 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  53.49 
 
 		 50 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0115  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>