More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4320 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4320  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1653 aa  3130    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  39.4 
 
 
1693 aa  990    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  38.75 
 
 
1762 aa  836    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  39.41 
 
 
1731 aa  831    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  40.04 
 
 
1745 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  40.04 
 
 
1745 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  38.62 
 
 
1721 aa  814    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  39.97 
 
 
1745 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.05 
 
 
7785 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.44 
 
 
7310 aa  629  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  37.55 
 
 
8211 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.4 
 
 
4090 aa  616  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.41 
 
 
4489 aa  612  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.76 
 
 
4502 aa  606  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.45 
 
 
6889 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.43 
 
 
3308 aa  598  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  34.17 
 
 
11233 aa  595  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 
6403 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 
5328 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  34.05 
 
 
3223 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  28.1 
 
 
1550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.55 
 
 
5596 aa  575  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.7 
 
 
3498 aa  576  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  28.99 
 
 
2581 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.36 
 
 
3291 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.35 
 
 
5953 aa  569  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.2 
 
 
2365 aa  570  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  29.28 
 
 
1569 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.29 
 
 
2614 aa  566  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  37.41 
 
 
4106 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.01 
 
 
2573 aa  559  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.05 
 
 
4332 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.71 
 
 
2385 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  32.2 
 
 
2189 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.81 
 
 
4336 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.93 
 
 
4960 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.06 
 
 
4342 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.64 
 
 
2448 aa  553  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 
1870 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.09 
 
 
2137 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.91 
 
 
4317 aa  549  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.78 
 
 
4968 aa  549  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.86 
 
 
2386 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  27.1 
 
 
1870 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.87 
 
 
4960 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.02 
 
 
2385 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.59 
 
 
3432 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.45 
 
 
2156 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.03 
 
 
3695 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.99 
 
 
2385 aa  546  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.74 
 
 
4342 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.05 
 
 
4318 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.9 
 
 
4317 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.33 
 
 
2385 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.24 
 
 
2385 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.27 
 
 
6676 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 
6661 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.33 
 
 
2385 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.54 
 
 
4317 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  26.17 
 
 
2410 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.74 
 
 
5750 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.51 
 
 
4317 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.7 
 
 
2385 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.42 
 
 
2385 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.98 
 
 
2385 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.44 
 
 
2156 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.59 
 
 
2386 aa  536  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.63 
 
 
13537 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.36 
 
 
6081 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  29.76 
 
 
2561 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.28 
 
 
5738 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0632  amino acid adenylation domain protein  35.23 
 
 
1479 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  32.41 
 
 
5213 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  34.22 
 
 
2403 aa  532  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.68 
 
 
3331 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.57 
 
 
3629 aa  532  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 
5620 aa  532  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.22 
 
 
6072 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  33.89 
 
 
6113 aa  533  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 
8914 aa  533  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.5 
 
 
2370 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.66 
 
 
4991 aa  533  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 
2125 aa  529  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.5 
 
 
2156 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.45 
 
 
7541 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 
6999 aa  526  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  30.34 
 
 
7168 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.4 
 
 
4478 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.58 
 
 
9498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  29.7 
 
 
9175 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.46 
 
 
3470 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  26.13 
 
 
4196 aa  515  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  31.01 
 
 
5230 aa  516  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  29.85 
 
 
1689 aa  515  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.02 
 
 
4747 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  34.15 
 
 
2098 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 
2155 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.14 
 
 
2154 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.66 
 
 
2201 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  26.57 
 
 
2193 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>