22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3649 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3649  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0781  hypothetical protein  65.49 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0650  hypothetical protein  60.08 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0663  hypothetical protein  60.08 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0610105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0643  hypothetical protein  60.08 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.132238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0821  hypothetical protein  56.54 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0092  hypothetical protein  56.87 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6398  hypothetical protein  56.76 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6763  hypothetical protein  56.71 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0329  hypothetical protein  55.21 
 
 		 268 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4613  hypothetical protein  53.57 
 
 		 290 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0846  hypothetical protein  51.36 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0396  hypothetical protein  52.65 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0954  hypothetical protein  51.89 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.987446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03640  hypothetical protein  52.12 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.790895  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0720  hypothetical protein  49.03 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0692  hypothetical protein  50.19 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0492  hypothetical protein  49.24 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0457  hypothetical protein  50.38 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.282782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6161  hypothetical protein  50.99 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.823489  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0889  hypothetical protein  49.03 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297266  hitchhiker  0.00151357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03710  hypothetical protein  46.64 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0079589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>