22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0457 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0457  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  720    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.282782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6161  hypothetical protein  70.11 
 
 		 275 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.823489  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4613  hypothetical protein  56.99 
 
 		 290 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6763  hypothetical protein  56.98 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0329  hypothetical protein  55.6 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0846  hypothetical protein  53.56 
 
 		 278 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0720  hypothetical protein  52.83 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0692  hypothetical protein  54.36 
 
 		 279 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6398  hypothetical protein  55.02 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0396  hypothetical protein  56.13 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0492  hypothetical protein  53.9 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0663  hypothetical protein  54.31 
 
 		 263 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0610105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0650  hypothetical protein  54.31 
 
 		 263 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0643  hypothetical protein  54.31 
 
 		 263 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.132238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0821  hypothetical protein  52.43 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0954  hypothetical protein  52.11 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.987446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0889  hypothetical protein  54.55 
 
 		 261 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297266  hitchhiker  0.00151357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03640  hypothetical protein  50.94 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.790895  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0092  hypothetical protein  51.48 
 
 		 264 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03710  hypothetical protein  49.43 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0079589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3649  hypothetical protein  51.69 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0781  hypothetical protein  49.81 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>