22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0329 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0329  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0396  hypothetical protein  87.74 
 
 
262 aa  434  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4613  hypothetical protein  61.87 
 
 
290 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6398  hypothetical protein  61.87 
 
 
264 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0846  hypothetical protein  59.85 
 
 
278 aa  281  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6763  hypothetical protein  58.82 
 
 
251 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0650  hypothetical protein  58.53 
 
 
263 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0663  hypothetical protein  58.53 
 
 
263 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0610105  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0643  hypothetical protein  58.14 
 
 
263 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0720  hypothetical protein  55.08 
 
 
255 aa  254  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6161  hypothetical protein  61 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.823489  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0821  hypothetical protein  55.43 
 
 
262 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0954  hypothetical protein  54.17 
 
 
269 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.987446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0457  hypothetical protein  55.6 
 
 
375 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.282782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0492  hypothetical protein  52.47 
 
 
288 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0781  hypothetical protein  56.37 
 
 
259 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0692  hypothetical protein  52.96 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0889  hypothetical protein  56.98 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297266  hitchhiker  0.00151357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0092  hypothetical protein  55.56 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3649  hypothetical protein  55.21 
 
 
255 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03710  hypothetical protein  52.09 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0079589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03640  hypothetical protein  52.12 
 
 
258 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.790895  normal  0.785558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>