25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3647 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  35.39 
 
 
173 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  33.9 
 
 
174 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  35.43 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  34.52 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  34.46 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  30.73 
 
 
173 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  30.73 
 
 
173 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  30.73 
 
 
173 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  31.21 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  34.46 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  34.09 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  31.61 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  31.46 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  29.24 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  24.43 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  31.09 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  26.74 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  28.7 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>