19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3458 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3458    100 
 
 		 2595 bp  5144    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0212053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1541    100 
 
 		 196 bp  389  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4089    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4054    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3878    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3460    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00185656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2954    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1135    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.491927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1843    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1946    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2696    100 
 
 		 193 bp  383  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  83.84 
 
 		 1014 bp  69.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    88.68 
 
 		 3753 bp  58  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  92.68 
 
 		 1344 bp  58  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472915  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3003    82.8 
 
 		 10439 bp  58  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.31 
 
 		 708 bp  54  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3209    96.67 
 
 		 686 bp  52  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.24 
 
 		 822 bp  50.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.89 
 
 		 834 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>