22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3126 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3126  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  847    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.219932  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5218  hypothetical protein  55.2 
 
 
448 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5306  hypothetical protein  55.2 
 
 
448 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5598  hypothetical protein  54.98 
 
 
448 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0743  hypothetical protein  54.47 
 
 
460 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1642  hypothetical protein  47.87 
 
 
465 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1409  hypothetical protein  51.35 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0621134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1116  hypothetical protein  48.88 
 
 
454 aa  319  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6580  hypothetical protein  31.08 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1527  group-specific protein  29.32 
 
 
414 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3432  hypothetical protein  27.33 
 
 
415 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000509012  hitchhiker  0.00000001707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1912  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2903  hypothetical protein  33.45 
 
 
436 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1726  group-specific protein  26.16 
 
 
415 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000930191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1747  hypothetical protein  25.67 
 
 
415 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2012  hypothetical protein  26.3 
 
 
415 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1941  hypothetical protein  25.87 
 
 
415 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.75971e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1906  hypothetical protein  25.58 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000229317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1768  hypothetical protein  25.58 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1770  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1991  hypothetical protein  25.29 
 
 
415 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00168161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3821  hypothetical protein  43.33 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>