23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6580 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6580  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  817    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1527  group-specific protein  64.49 
 
 
414 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1912  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3432  hypothetical protein  32.69 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000509012  hitchhiker  0.00000001707 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1941  hypothetical protein  32.93 
 
 
415 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.75971e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1747  hypothetical protein  32.93 
 
 
415 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1726  group-specific protein  32.69 
 
 
415 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000930191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1768  hypothetical protein  32.93 
 
 
415 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2012  hypothetical protein  32.93 
 
 
415 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1906  hypothetical protein  32.93 
 
 
415 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000229317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1991  hypothetical protein  32.2 
 
 
415 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00168161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1770  hypothetical protein  31.23 
 
 
415 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117483  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2903  hypothetical protein  32.27 
 
 
436 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1642  hypothetical protein  29.94 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1116  hypothetical protein  29.67 
 
 
454 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0743  hypothetical protein  30.35 
 
 
460 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5306  hypothetical protein  30.22 
 
 
448 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5218  hypothetical protein  30.22 
 
 
448 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5598  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1409  hypothetical protein  32.34 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0621134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3126  hypothetical protein  30.41 
 
 
442 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.219932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2371  hypothetical protein  23.45 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000309588  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2480  hypothetical protein  29.81 
 
 
390 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000335253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>