11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2927 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  898    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  35.9 
 
 
447 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  34.19 
 
 
429 aa  232  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1863  hypothetical protein  33.64 
 
 
427 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1910  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
427 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1844  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 
429 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  32.69 
 
 
360 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 
421 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
630 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.85 
 
 
1383 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>