15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1549 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  38.57 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  36.96 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  34.81 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  30.5 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  33.81 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  30.37 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  32.81 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  25.17 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  34.67 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  31.29 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  25.69 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>