28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1500 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  39.52 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  39.52 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  39.62 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  41.96 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  37.9 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  38.26 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  35.51 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  39.36 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  38.54 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  40.45 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  42.53 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  37.88 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  35.53 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4571  hypothetical protein  37.72 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6228  normal  0.0680023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  37.27 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3134  hypothetical protein  33.96 
 
 		 118 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>