15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3094 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3094  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
309 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1379  hypothetical protein  45.21 
 
 
320 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0957  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.54 
 
 
320 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0657  hypothetical protein  37.91 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1108  hypothetical protein  38.21 
 
 
320 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62512  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1413  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1773  hypothetical protein  29.31 
 
 
303 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.600035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3621  hypothetical protein  34.36 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  26.21 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4197  hypothetical protein  35.69 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2187  hypothetical protein  25.97 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020758  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  25.85 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.67 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  23.58 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  35.56 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>