24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2519 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  302  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.425061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3128  hypothetical protein  38.3 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.738659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2727  hypothetical protein  38.3 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  34.29 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  30.39 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  29.52 
 
 		 406 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.13 
 
 		 406 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.62 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  30.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  25.26 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  28.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  29.35 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  26.15 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  26.23 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.11 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  29.29 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.53 
 
 		 405 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  28.43 
 
 		 410 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.67 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  23.9 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  31.31 
 
 		 411 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  25.96 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.29 
 
 		 409 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>