170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1258 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  100 
 
 		 162 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  54.73 
 
 		 192 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  49.38 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  47.74 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  51.72 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  51.03 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  50.64 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  48.39 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  47.1 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  49.03 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  49.03 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  48.08 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  46.1 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  47.74 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  46.45 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  48.72 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  48.72 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  48.72 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  48.72 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  48.72 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  48.39 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  48.39 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  48.39 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  48.39 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  47.74 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  51.05 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  46.45 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  51.05 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  47.74 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  47.1 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  47.1 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  48.78 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  47.74 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  47.1 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  47.1 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  47.1 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  43.75 
 
 		 177 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  47.1 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  47.44 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  47.1 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  46.45 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  47.1 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  47.1 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  47.1 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  47.59 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  45.51 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  48.67 
 
 		 184 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  44.87 
 
 		 185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  48.67 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  48.75 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  47.18 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  44.97 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  44.97 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  45.62 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  44.3 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  48 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  40.13 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  39.47 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  46.98 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  46.98 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  45.77 
 
 		 197 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  44.53 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  40.52 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  39.87 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  48.59 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  43.4 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  34.81 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  39.1 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  35.44 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  48 
 
 		 186 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  38.27 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  36.54 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  37.18 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  36.54 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  40.65 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  40.65 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  37.18 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  35.03 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  40.29 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  35.8 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  38.41 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  38.41 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  35.9 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  36.76 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  39.74 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  36.54 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  36.54 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  38.46 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  35.9 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>