26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2148 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  70.87 
 
 		 607 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  100 
 
 		 538 aa  1090    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  66.94 
 
 		 536 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  60.52 
 
 		 504 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  29.59 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  31.35 
 
 		 411 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  27.71 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  28.57 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.33 
 
 		 296 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  26.01 
 
 		 420 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.9 
 
 		 295 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  27.5 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  26.83 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  26.88 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  26.98 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  25.42 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.77 
 
 		 281 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  23.29 
 
 		 311 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  23.29 
 
 		 311 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>