26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1249 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  49.32 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  52.31 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  43.44 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  37.4 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  34.68 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  34.68 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  34.35 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  34.43 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  33.61 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  33.61 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  34.45 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  32.76 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3803  hypothetical protein  32.56 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  31.09 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  31.09 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  31.09 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  30.77 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  29.84 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  29.84 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  29.84 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  31.07 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  26.55 
 
 		 127 aa  43.5  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  20 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  26.85 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>