22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1861 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  100 
 
 		 410 aa  834    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  38.79 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1426  efflux family outer membrane protein  40.73 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2869  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 412 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3358  outer membrane efflux family protein, putative  27.84 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4083  outer membrane efflux family protein, putative  25.45 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0539  outer membrane efflux family protein, putative  30.9 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0554  outer membrane efflux family protein, putative  25.32 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3849  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 495 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3793  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3975  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0518  outer membrane efflux family protein, putative  24.28 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0516  outer membrane efflux family protein, putative  24 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3343  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0516  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3515  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 456 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0476  outer membrane efflux family protein, putative  24.49 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.16 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0475  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>