19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1011 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.3 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  33.1 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  30.58 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  29.7 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  28.72 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.46 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  30.77 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  31.52 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.87 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  29.14 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 		 642 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.29 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  27.24 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 		 709 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>