73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2197 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2197  family 4 glycosyl transferase  100 
 
 
300 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6508  glycosyl transferase  40.26 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  33.11 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  28.24 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  32.72 
 
 
762 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  36.13 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
496 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  33.91 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  33.76 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.34 
 
 
391 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.52 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  30.52 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  30.77 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
355 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  31.87 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.22 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
372 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  35.62 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  25.81 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  26.98 
 
 
354 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  35.26 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  35.26 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
495 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  26.11 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  27.05 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  36.36 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  31.47 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
353 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.67 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
357 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.9 
 
 
359 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  32.29 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  27.98 
 
 
399 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.9 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.38 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  30.09 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.84 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  24.56 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  20.41 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  25 
 
 
357 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1754  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
394 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.33 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
357 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1290  glycosyl transferase family 4  32.09 
 
 
372 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  37.23 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  33.16 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  24.56 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  24.56 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  24.56 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  24.56 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0516  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0493099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  30.49 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.14 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  23.47 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  23.47 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  31.03 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
369 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  26.25 
 
 
393 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
591 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.54 
 
 
407 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
542 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>