16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1930 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 360 aa  725    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  54.44 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  47.35 
 
 		 376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  47.66 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  46.26 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  39.39 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  32.86 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  30.93 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  30.46 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  33.13 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  29.24 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  28.3 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  27.43 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.27 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.84 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>