19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1903 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  100 
 
 
184 aa  362  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  67.78 
 
 
182 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  64.53 
 
 
191 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  56.99 
 
 
201 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  57.45 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  58.15 
 
 
182 aa  197  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  57.61 
 
 
197 aa  197  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  56.82 
 
 
190 aa  194  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  60.65 
 
 
184 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  48.63 
 
 
182 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  50.57 
 
 
177 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  52.98 
 
 
191 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  51.9 
 
 
186 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  45.71 
 
 
185 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  43.69 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  38.46 
 
 
119 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  34.52 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  28.65 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  27.51 
 
 
174 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>