15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0602 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0602  ABC transporter protein  100 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  59.49 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4275  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.273706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1855  hypothetical protein  47.26 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.076354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0451  hypothetical protein  42.33 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0978  hypothetical protein  32.05 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4167  hypothetical protein  36.68 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4448  putative integral membrane protein  40.97 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.440749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3787  hypothetical protein  39.89 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06890  hypothetical protein  30.96 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3974  hypothetical protein  30.6 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  35.05 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  35.71 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  36.08 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  27.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>