19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4167 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4167  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3787  hypothetical protein  95.76 
 
 
236 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  40.87 
 
 
238 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0978  hypothetical protein  38.04 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0451  hypothetical protein  41.05 
 
 
239 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0602  ABC transporter protein  37.02 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1855  hypothetical protein  40.68 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.076354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4275  hypothetical protein  41.45 
 
 
238 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.273706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4448  putative integral membrane protein  38.05 
 
 
239 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.440749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06890  hypothetical protein  32.68 
 
 
238 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3974  hypothetical protein  37.1 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  31.25 
 
 
330 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
330 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
330 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  31.25 
 
 
330 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  31.25 
 
 
330 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
330 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
330 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>