19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1685 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 665 aa  1329    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  26.6 
 
 		 653 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  24.35 
 
 		 751 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  24.26 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  24.83 
 
 		 770 aa  145  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  25.3 
 
 		 714 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  24.46 
 
 		 714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  29.34 
 
 		 972 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  27.38 
 
 		 960 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  26.02 
 
 		 842 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  29.37 
 
 		 1047 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  26.97 
 
 		 880 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  28.67 
 
 		 1035 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  25.7 
 
 		 814 aa  64.3  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  25.7 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  28.07 
 
 		 752 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  27.7 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  31.75 
 
 		 840 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 		 530 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>