50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1339 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1339  putative mercuric transport protein  100 
 
 
117 aa  228  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.162725  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  58.12 
 
 
116 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  59.83 
 
 
116 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  59.83 
 
 
116 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  59.83 
 
 
116 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  57.26 
 
 
116 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  58.12 
 
 
116 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  58.12 
 
 
116 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  58.97 
 
 
116 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  58.97 
 
 
116 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  58.97 
 
 
116 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  55.56 
 
 
116 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  56.9 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  57.26 
 
 
116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  55.65 
 
 
123 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  53.91 
 
 
118 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  52.99 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  55.17 
 
 
123 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1300  putative mercuric transport protein  61.54 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.703768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  58.12 
 
 
116 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0167  putative mercuric transport protein  58.97 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2313  putative mercuric transport protein  60.68 
 
 
116 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214741  hitchhiker  0.0000267123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1784  putative mercuric transport protein  56.41 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598892  normal  0.981722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  50.43 
 
 
116 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  47.32 
 
 
115 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  44.44 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  50 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  46.3 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  41.32 
 
 
123 aa  95.9  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  42.06 
 
 
115 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  46.3 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  40.91 
 
 
117 aa  95.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2685  mercuric transporter MerT  43.81 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  47.66 
 
 
116 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4797  putative mercuric transport protein  57.45 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  40.37 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  42.57 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  39.13 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  39.05 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2901  mercuric transporter MerT  41.28 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  31.9 
 
 
199 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0238  mercuric transporter MerT  39.56 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  45.33 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  37.38 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  37.38 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  37.38 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  37.38 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  29.91 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  28.44 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  31.58 
 
 
372 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>