45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0170 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  85.22 
 
 
115 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  78.26 
 
 
115 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  70.43 
 
 
115 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  66.04 
 
 
106 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  52.43 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  50.94 
 
 
116 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  49.52 
 
 
116 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  54.74 
 
 
118 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  53 
 
 
131 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  48.57 
 
 
116 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  48.57 
 
 
116 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  53.12 
 
 
115 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  47.62 
 
 
116 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  49.52 
 
 
116 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2313  putative mercuric transport protein  58.33 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214741  hitchhiker  0.0000267123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1300  putative mercuric transport protein  58.33 
 
 
116 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.703768 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0167  putative mercuric transport protein  57.83 
 
 
116 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  49.02 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  49.02 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  49.02 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  48.04 
 
 
116 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  48.04 
 
 
116 aa  95.9  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  48.04 
 
 
116 aa  95.9  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1784  putative mercuric transport protein  48.91 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598892  normal  0.981722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  50.52 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  46.39 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  42.06 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  48.28 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  52.44 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  50 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  42.99 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  42.31 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2685  mercuric transporter MerT  44.34 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1339  putative mercuric transport protein  43.01 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.162725  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  41.57 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  35.05 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  37.23 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4797  putative mercuric transport protein  47.95 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2901  mercuric transporter MerT  36.08 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0238  mercuric transporter MerT  41.67 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
372 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4418  mercuric ion transport protein, MerT  34.85 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  42.62 
 
 
209 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2563  mercuric ion transport protein, MerT  32.93 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>