44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3491 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  100 
 
 
115 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  86.09 
 
 
115 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  78.26 
 
 
115 aa  187  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  71.3 
 
 
115 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  65.09 
 
 
106 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  50 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  50.93 
 
 
116 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  45.13 
 
 
116 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  45.13 
 
 
116 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  52.94 
 
 
116 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  48.57 
 
 
116 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1300  putative mercuric transport protein  54.74 
 
 
116 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.703768 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  55.79 
 
 
118 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  50 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  50 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  50 
 
 
116 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  44.25 
 
 
116 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2313  putative mercuric transport protein  54.74 
 
 
116 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214741  hitchhiker  0.0000267123 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  46.02 
 
 
116 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0167  putative mercuric transport protein  51.06 
 
 
116 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  49.07 
 
 
116 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  49.07 
 
 
116 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  49.07 
 
 
116 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  48.96 
 
 
115 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1784  putative mercuric transport protein  50.53 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598892  normal  0.981722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  45.19 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  45.79 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  53.57 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  43.4 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  41.67 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2685  mercuric transporter MerT  46.15 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  47.92 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  40.62 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  42.31 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1339  putative mercuric transport protein  47.87 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.162725  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  41.51 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  37 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  37.27 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4797  putative mercuric transport protein  51.39 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0238  mercuric transporter MerT  45.24 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2901  mercuric transporter MerT  37.5 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  40 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  35.56 
 
 
372 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4418  mercuric ion transport protein, MerT  48.65 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>