13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0935 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2309  hypothetical protein  67.7 
 
 		 666 aa  933    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.444355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1330    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.002395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52360  hypothetical protein  89.16 
 
 		 665 aa  1184    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6973  hypothetical protein  30.93 
 
 		 683 aa  316  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000276494  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4842  hypothetical protein  30.88 
 
 		 680 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4930  hypothetical protein  30.88 
 
 		 680 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3858  hypothetical protein  29.79 
 
 		 680 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611595  normal  0.0467338 
 
 
-
 
NC_002950  PG1436  ATPase, putative  27.79 
 
 		 672 aa  219  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.120762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3659  ATPase, putative  26.99 
 
 		 667 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0800074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3861  hypothetical protein  22.94 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3190  hypothetical protein  23.46 
 
 		 708 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0229  ATPase family protein  20.64 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00298001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1497  histidine kinase  25.36 
 
 		 621 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00383985  normal  0.0346949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>