219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0561 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  75.05 
 
 		 463 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  81.72 
 
 		 458 aa  784    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  100 
 
 		 467 aa  932    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  84.55 
 
 		 460 aa  798    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  73.9 
 
 		 465 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  67.09 
 
 		 471 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  72.01 
 
 		 483 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  74.56 
 
 		 465 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  74.67 
 
 		 460 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  74.31 
 
 		 471 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  57.02 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1516  Nitric-oxide reductase  55.25 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  53.75 
 
 		 449 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  53.8 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  54.29 
 
 		 448 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  54.08 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  56.7 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  57.2 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  54.39 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1849  cytochrome c oxidase, subunit I  55.51 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  53.33 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  53.75 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1968  cytochrome c oxidase, subunit I  52.9 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0823  nitric-oxide reductase subunit B  45.33 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  41.83 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2767  Nitric-oxide reductase  44.69 
 
 		 457 aa  361  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3435  cytochrome c oxidase, subunit I  45.12 
 
 		 457 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464275  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  42.26 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1255  nitric-oxide reductase subunit B  41.85 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  42.21 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  36.75 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  38.14 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  29.55 
 
 		 787 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2253  Nitric-oxide reductase  28.35 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  28.01 
 
 		 739 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  28.69 
 
 		 748 aa  149  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  28.76 
 
 		 762 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.78 
 
 		 761 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.89 
 
 		 763 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  28.43 
 
 		 774 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  32.34 
 
 		 762 aa  133  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.9 
 
 		 762 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  29.59 
 
 		 776 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  26.53 
 
 		 773 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.94 
 
 		 761 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  31.42 
 
 		 763 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  30.27 
 
 		 758 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  29.07 
 
 		 760 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.78 
 
 		 761 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  30.27 
 
 		 758 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  29 
 
 		 1077 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  26.83 
 
 		 773 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  30.33 
 
 		 769 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.52 
 
 		 761 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  27.97 
 
 		 762 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  27.97 
 
 		 762 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.62 
 
 		 758 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.75 
 
 		 762 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  27.69 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  29.44 
 
 		 756 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.53 
 
 		 763 aa  123  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  29.65 
 
 		 769 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  28.03 
 
 		 758 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.39 
 
 		 762 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  28.57 
 
 		 840 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  26.12 
 
 		 772 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.16 
 
 		 758 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  26.12 
 
 		 772 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  26.12 
 
 		 772 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.75 
 
 		 761 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  27.62 
 
 		 762 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  27.65 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  27.65 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  27.86 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  27.65 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  27.65 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  27.65 
 
 		 762 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  27.65 
 
 		 762 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  27.25 
 
 		 783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  27.25 
 
 		 783 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  27.25 
 
 		 783 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  26.4 
 
 		 767 aa  113  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  27.07 
 
 		 780 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  26.67 
 
 		 764 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  26.86 
 
 		 780 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  26.28 
 
 		 756 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  25.87 
 
 		 756 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  24.24 
 
 		 761 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  27.54 
 
 		 759 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  25.97 
 
 		 763 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  25.76 
 
 		 763 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  23.62 
 
 		 744 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  25.76 
 
 		 763 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  26.34 
 
 		 761 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  24.95 
 
 		 759 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  26.37 
 
 		 743 aa  97.8  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  30 
 
 		 720 aa  96.7  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  27.14 
 
 		 769 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  24.95 
 
 		 759 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  26.77 
 
 		 747 aa  93.6  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>