More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0033 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0034  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0029  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0007  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0023  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0057  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0083  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00420307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2074  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00776764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0018  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2328  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0021  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00416527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0006  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00464814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0063  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00661902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0126  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000381785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0071  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000469836  normal  0.108632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0003  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.897638  normal  0.0843141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0015  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0032  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>